马建民医师在从医23年的时间里，积累了丰富的临床经验，诊治了大量的眼科疾患病人，尤其擅长各种疑难眼肿瘤眼眶病的诊疗，完成了大量的疑难性眼肿瘤眼眶病的手术，为广大患者解除了病痛，给广大患者带来光明，并挽救了一些恶性眼肿瘤患者的生命，受到广大患者的好评。另外，他完成编写并正式出版了国内首套眼肿瘤眼眶病手术系列音像教材，这为国内眼科医师更好的开展和完成此类手术提供了借鉴资料。在国内外撰写和发表文章近百篇;参编参译著作20余本，其中主编(译)5本，副主编(译)5本，医学院校眼科学教材6本。承担或以主要研究者参加国家级课题5项(其中国家自然基金课题4项)、省市级课题7项;获得奖励10余项。指导和协助指导研究生30余名。目前兼任《中国医药科学》栏目主编，《中华眼科杂志》、《中华实验眼科杂志》、《中华临床杂志(电子版)》、《国际眼科时讯》、《中华眼科医学杂志(电子版)》等多本杂志的编委。兼任北京市科委医药领域评审专家、中华医学会医疗鉴定专家库成员、国家自然基金委一审评审专家等。马建民医师2004年入选北京科技新星计划，2009获得中华医学会眼科学分会颁发的“中华眼科学会奖”，2011年入选北京市卫生系统高层次卫生技术人才培养计划,2012年入选北京地区优秀中青年医师，2013年获得第四届中国眼科医师奖。